Para ilmuwan berebut untuk menilai virus korona yang bermutasi


PARIS, PRANCIS – Ketika lusinan negara memblokir arus orang dan barang dari Inggris untuk menghindari jenis baru dan lebih menular dari virus corona, para ilmuwan berlomba untuk memahami bagaimana virus itu muncul dan cakupan ancamannya.

Berikut adalah beberapa pertanyaan kunci yang mereka ajukan, dan jawaban yang muncul sejauh ini.

Seberapa sering VIRUS MUTASI?

Sepanjang waktu, tetapi beberapa virus melakukannya lebih dari yang lain.

Vaksin campak dua dosis, misalnya, dapat bertahan seumur hidup, sementara campuran dalam suntikan flu berubah setiap tahun untuk mengimbangi perubahan bentuk genetik.

Coronavirus ada di antara keduanya, dan salah satu yang telah merusak dunia tahun ini, yang dikenal sebagai SARS-CoV-2, tidak terkecuali.

“Virus terus-menerus berubah melalui mutasi dan munculnya varian baru merupakan kejadian yang diharapkan dan tidak dengan sendirinya menjadi perhatian,” kata Pusat Pencegahan dan Pengendalian Penyakit Eropa (ECDC), Minggu dalam laporan penilaian ancaman strain baru.

Adapun patogen yang menyebabkan Covid-19, “bahkan pada bulan Maret, ada delapan garis keturunan utama yang semuanya terpisah,” kata Susan Hopkins, dosen senior penyakit menular di Imperial College London, kepada wartawan dalam konferensi pers di Zoom, Senin.

Pertanyaan yang lebih kritis adalah di mana dalam virus mutasi tersebut terjadi, dan apakah mutasi itu akan membuatnya lebih menular dan / atau mematikan.

Sebelum kemunculan strain yang lebih menular ini di Inggris, variasi genetik lainnya sebagian besar bersifat jinak.

BAGAIMANA STRAIN BARU BERUBAH?

Apakah varian SARS-CoV-2 menemukan inang untuk diinfeksi secara signifikan ditentukan oleh antarmuka antara apa yang disebut protein lonjakan virus dan reseptor spesifik di permukaan banyak sel manusia yang dikenal sebagai ACE2.

Semakin mudah virus menempel pada reseptor, semakin besar kemungkinan infeksi akan menyusul.

Mutasi baru, yang dikenal sebagai varian 501Y, mungkin telah berubah dengan cara yang meningkatkan peluang keberhasilan pemasangannya.

“Ada sekelompok mutasi yang sangat tidak biasa yang terkait dengan varian ini – 22 perubahan kode di seluruh genom virus,” kata Wendy Barclay, kepala departemen penyakit infeksi di Imperial College London dan anggota NERVTAG, sekelompok ilmuwan. menasihati pemerintah Inggris tentang ancaman yang ditimbulkan oleh penyakit pernapasan yang muncul.

Mutasi yang diamati pada protein lonjakan, katanya kepada wartawan, “akan memudahkan virus memasuki sel, dan secara biologis dapat menjelaskan peningkatan penularan.”

Sedikitnya kode genetik yang hilang di wilayah lain, dibandingkan dengan SARS-CoV-2 generasi sebelumnya dari mana 501Y muncul, juga dapat meningkatkan kemampuannya untuk menyebar, katanya.

BERAPA BANYAK LEBIH MENULAR?

Dalam mengumumkan tindakan penguncian yang lebih ketat selama liburan Natal, Perdana Menteri Inggris Boris Johnson mengatakan pada hari Sabtu bahwa jenis virus baru “mungkin hingga 70 persen lebih mudah menular daripada versi asli penyakit tersebut.”

Penilaian itu didasarkan pada data awal dari sekuensing genom virus yang dikumpulkan dari London dan bagian tenggara Inggris.

Pada awal November, para ilmuwan menemukan varian baru bertanggung jawab atas lebih dari seperempat infeksi di area ini. Pada minggu yang berakhir pada 9 Desember, itu menyumbang lebih dari 60 persen dari semua kasus baru.

Sejak pengumuman mengejutkan Johnson, yang memicu larangan penerbangan komersial dan penutupan perbatasan, para ilmuwan di Inggris telah mengumpulkan lebih banyak data.

“Kami sekarang memiliki keyakinan tinggi bahwa varian ini memiliki keunggulan penularan dibandingkan varian virus lain yang saat ini ada di Inggris,” kata Peter Horby, seorang profesor penyakit menular yang muncul di Universitas Oxford dan ketua NERVTAG.

Perhitungan terakhir, tambahnya, menunjukkan 501Y adalah 50 hingga 70 persen lebih menular.

Indikator lain dari kemampuannya untuk menyebar adalah nomor reproduksi varian, atau “R rate” – jumlah rata-rata kasus baru yang dihasilkan oleh satu orang yang terinfeksi.

Apa pun di atas 1.0 berarti virus terus mencari inang baru dan menyebar ke seluruh komunitas, kabupaten, atau negara.

“Bahkan selama penguncian (baru-baru ini) di Inggris, virus ini memiliki R-number sekitar 0,4 lebih besar daripada strain non-varian,” kata Neil Ferguson, direktur MRC Center for Global Infectious Disease Analysis dan anggota NERVTAG.

“Strain non-varian memiliki nomor R sekitar 0.8, tetapi varian ini memiliki R 1.2 atau bahkan lebih tinggi.”

Itu bisa menjadi berita buruk bagi upaya mengekang penyebaran Covid-19, yang telah merenggut lebih dari 67.000 nyawa di Inggris dan 1,7 juta di seluruh dunia.

“Saya pikir itu sangat mungkin menjadi ketegangan dominan di Inggris mengingat tren yang telah kita lihat sejauh ini,” kata Ferguson.

Organisasi Kesehatan Dunia (WHO) pada Selasa mengatakan bahwa “analisis awal menunjukkan bahwa varian tersebut dapat menyebar lebih mudah di antara orang-orang,” tetapi mengatakan lebih banyak penelitian diperlukan untuk menilai dampaknya pada perawatan dan vaksin.

DI MANA TEGANGAN BARU MUNCUL?

Para ilmuwan tidak yakin di mana varian yang lebih menular – secara resmi dikenal sebagai SARS-CoV-2 VUI 202012/01 – pertama kali muncul, tetapi banyak yang menduga Inggris adalah titik nol.

Kasus pertama yang diketahui diambil sampelnya pada 20 September.

“Sangat mungkin muncul di sini, tetapi kemungkinan juga muncul di negara lain,” kata Hopkins dari Imperial College London.

Denmark, Belanda, Australia dan Italia memiliki semua kasus yang dilaporkan, katanya.

Varian dengan beberapa penghapusan genetik yang sama juga telah diidentifikasi di Afrika Selatan, tetapi diperkirakan telah berevolusi secara terpisah – memperkuat gagasan bahwa mutasi memberikan “keuntungan transmisi”.

Mungkin juga, kata para ilmuwan, bahwa 501Y sudah lebih luas daripada yang diperkirakan, tetapi belum terdeteksi.

Satu-satunya cara untuk mengenali versi mutasi SARS-CoV-2 adalah dengan mengurutkan seluruh genom virus, tetapi Denmark dan Inggris adalah satu-satunya negara di Eropa yang melakukannya secara rutin.

“Inggris mungkin menjadi korban dari keberhasilan teknis mereka sendiri dalam menyoroti kemunculan varian 501Y,” kata Profesor Brendan Wren dari Sekolah Kebersihan & Pengobatan Tropis London, mencatat bahwa Inggris mungkin diperlakukan “sebagai penderita kusta dunia.”

Horby dan ilmuwan NERVTAG lainnya mengatakan pada hari Senin bahwa mereka tidak mungkin melacak strain tersebut kembali ke “pasien nol”, tetapi memiliki gagasan tentang bagaimana itu mungkin muncul.

Hipotesisnya adalah bahwa ini melewati seseorang yang mengalami imunosupresi yang oleh karena itu memiliki sirkulasi mutasi hidup dalam jangka waktu yang lama, katanya.

APAKAH 501Y LEBIH VIRULEN?

“Tidak ada indikasi pada saat ini peningkatan keparahan infeksi yang terkait dengan varian baru,” kata ECDC dalam penilaian ancamannya.

Namun, kesimpulan ini “ditentang oleh fakta bahwa sebagian besar kasus dilaporkan pada orang yang berusia di bawah 60 tahun, yang cenderung tidak mengalami gejala parah.”

Pada saat yang sama, “ada petunjuk bahwa virus ini memiliki kecenderungan lebih tinggi untuk menginfeksi anak-anak,” kata Ferguson.

Sekalipun terbukti benar, itu tidak berarti bahwa virus tersebut “menyasar” anak-anak, yang hingga saat ini cenderung kurang rentan terhadap infeksi dan, ketika mereka tertular, gejala yang parah, kata Barclay.

“Virus sebelumnya lebih sulit mengikat ACE2 dan masuk ke sel (manusia),” jelasnya. Itu membuat orang dewasa – dengan lebih banyak reseptor ACE2 di hidung dan tenggorokan mereka – menjadi target yang lebih mudah dibandingkan dengan anak-anak.

“Jika strain baru memiliki waktu yang lebih mudah untuk memasuki dan mengikat ke sel, itu akan menempatkan anak-anak di lapangan bermain yang lebih setara,” tambah Barclay, mencatat dampak tambahan dari percampuran sosial anak muda, terutama di sekolah.

APAKAH VAKSIN MASIH BEKERJA?

Para ilmuwan di Inggris dan di tempat lain sedang menguji galur baru tersebut terhadap beberapa vaksin SARS-CoV-2, tetapi sejauh ini tidak ada indikasi bahwa vaksin tersebut akan kurang efektif melawan 501Y.

“Mungkin saja kami perlu memperbarui vaksin, mungkin tidak setiap tahun,” kata Barclay. “Tapi kami perlu memantau virus ini ke depan.”

Memutakhirkan generasi baru yang disebut vaksin RNA messenger, tambahnya, akan jauh lebih mudah daripada memodifikasi vaksin flu, seperti yang terjadi setiap tahun.

Kedua vaksin terkemuka di Eropa dan AS – satu dibuat oleh Pfizer-BioNTech, yang lainnya oleh Moderna – berbasis RNA.

Salah satu pendiri BioNTech, Ugur Sahin, Selasa, mengatakan “sangat mungkin” bahwa vaksinnya akan bekerja melawan strain bermutasi yang terdeteksi di Inggris, menambahkan bahwa perusahaan dapat menyesuaikan vaksin jika perlu dalam enam minggu.

Para peneliti juga sedang menyelidiki kemungkinan dampak strain baru pada pengujian dan perawatan Covid-19, meskipun sejauh ini tidak banyak yang menunjukkan bahwa keduanya akan terganggu secara signifikan.

“Kami harus berhati-hati dalam kesimpulan kami, ini masih awal dan masih banyak ketidakpastian tentang banyak aspek dari varian baru ini,” kata anggota NERVTAG Ferguson.

Source : Totobet HK